Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A11Q02978 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms