Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ID3Q02535 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ID3Q02535 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ID3Q02535 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms