Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF2Q01130 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF2Q01130 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms