Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms