Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms