Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKOR1P84550 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms