Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL30P62888 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL30P62888 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL30P62888 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL30P62888 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms