Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms