Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP107P57740 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP107P57740 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP107P57740 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP107P57740 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP107P57740 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP107P57740 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP107P57740 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP107P57740 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP107P57740 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP107P57740 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP107P57740 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP107P57740 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP107P57740 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP107P57740 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP107P57740 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP107P57740 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP107P57740 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP107P57740 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP107P57740 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP107P57740 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP107P57740 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP107P57740 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP107P57740 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms