Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms