Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP53609 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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PGGT1BP53609 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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PGGT1BP53609 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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PGGT1BP53609 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
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PGGT1BP53609 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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PGGT1BP53609 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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PGGT1BP53609 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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PGGT1BP53609 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PGGT1BP53609 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PGGT1BP53609 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PGGT1BP53609 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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