Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP11P51784 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP11P51784 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP11P51784 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP11P51784 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP11P51784 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP11P51784 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms