Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTAP49354 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTAP49354 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FNTAP49354 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FNTAP49354 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FNTAP49354 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FNTAP49354 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTAP49354 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms