Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1P48651 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms