Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPGP40121 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPGP40121 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAPGP40121 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAPGP40121 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPGP40121 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPGP40121 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms