Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms