Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP1P29466 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP1P29466 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CASP1P29466 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP1P29466 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP1P29466 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms