Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF1BP20333 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms