Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPO95166 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms