Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SURF6O75683 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SURF6O75683 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SURF6O75683 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF6O75683 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF6O75683 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF6O75683 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF6O75683 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF6O75683 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF6O75683 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF6O75683 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF6O75683 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF6O75683 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF6O75683 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF6O75683 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF6O75683 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF6O75683 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms