Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG13O75143 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG13O75143 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG13O75143 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG13O75143 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG13O75143 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms