Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms