Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP2AO43633 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms