Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms