Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms