Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
J3KT08 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
J3KT08 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
J3KT08 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
J3KT08 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
J3KT08 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
J3KT08 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
J3KT08 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
J3KT08 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
J3KT08 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
J3KT08 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
J3KT08 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms