Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms