Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA3AA6NCI4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms