Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J248

TRAV1-1, T-cell receptor alpha variable 1-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV1-1A0A0B4J248 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV1-1A0A0B4J248 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms