Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRE2-209ENST00000596991 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A19-204ENST00000416858 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ELP2-205ENST00000442325 2722 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GM2A-201ENST00000357164 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NVL-203ENST00000391875 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX9-AS1-204ENST00000434703 3032 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ELP3-202ENST00000380353 3078 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 INTS7-201ENST00000366992 3380 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CYLD-214ENST00000569418 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 POLE3-201ENST00000374169 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ASTN1-204ENST00000424564 3685 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SSR3-201ENST00000265044 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TSNAXIP1-206ENST00000561639 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FLRT1-201ENST00000246841 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LY9-201ENST00000263285 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPA1-203ENST00000546500 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R3C-201ENST00000238994 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF10-203ENST00000413266 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02028-202ENST00000432154 2666 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms