Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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COL4A6Q14031 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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COL4A6Q14031 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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COL4A6Q14031 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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COL4A6Q14031 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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COL4A6Q14031 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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COL4A6Q14031 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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COL4A6Q14031 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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COL4A6Q14031 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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