Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ARL2-SNX15V9GYD0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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