Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms