Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNQ9UQP3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms