Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIZ1Q9ULV3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms