Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms