Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms