Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 WDR6-215ENST00000489427 564 ntTSL 423.11■■□□□ 1.292e-9■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 WDR6-217ENST00000491365 491 ntTSL 320.16■□□□□ 0.822e-9■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 325.37■■□□□ 1.655e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 MIDN-202ENST00000586757 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 537.42■■■■□ 3.588e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.668e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.128e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-213ENST00000455998 557 ntTSL 430.84■■■□□ 2.531e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-211ENST00000445959 831 ntTSL 328.3■■■□□ 2.121e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-206ENST00000429625 750 ntTSL 522.31■■□□□ 1.161e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 LRRC75B-202ENST00000404045 1417 ntTSL 343■■■■■ 4.471e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.381e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 LRRC75B-203ENST00000446942 1828 ntTSL 542.24■■■■■ 4.351e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 LRRC75B-206ENST00000465334 957 ntTSL 241.93■■■■■ 4.31e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 LRRC75B-204ENST00000460524 2276 ntTSL 541.53■■■■■ 4.241e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 LRRC75B-207ENST00000491910 2943 ntTSL 231.7■■■□□ 2.661e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 LRRC75B-205ENST00000464490 575 ntTSL 425.37■■□□□ 1.651e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 TRIO-221ENST00000513206 7995 ntTSL 518.67■□□□□ 0.581e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 TRIO-222ENST00000515144 7455 ntTSL 1 (best)17.08■□□□□ 0.321e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 TRIO-218ENST00000512070 8907 ntTSL 216.69■□□□□ 0.261e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.11e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 TRIO-214ENST00000509967 4949 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 BCR-207ENST00000463770 168 ntTSL 1 (best)22.55■■□□□ 1.22e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 BCR-214ENST00000487679 231 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.312e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PTMA-206ENST00000412128 863 ntTSL 337.92■■■■□ 3.665e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.053e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PTMA-207ENST00000440384 222 ntTSL 329.15■■■□□ 2.265e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 TTYH3-206ENST00000477439 731 ntTSL 224.95■■□□□ 1.592e-14■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-14■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.711e-6■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.711e-6■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 SPN-205ENST00000563039 1853 ntTSL 529.38■■■□□ 2.291e-6■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 SPN-203ENST00000436527 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)28.27■■■□□ 2.121e-6■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.758e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-209ENST00000473207 578 ntTSL 423.38■■□□□ 1.338e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-211ENST00000481937 630 ntTSL 323.38■■□□□ 1.338e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-225ENST00000533884 595 ntTSL 423.38■■□□□ 1.338e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-217ENST00000526917 663 ntTSL 319.28■□□□□ 0.688e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.658e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-207ENST00000462759 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.488e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.131e-6■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-214ENST00000489990 1012 ntTSL 515.18■□□□□ 0.028e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.788e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-204ENST00000435274 2670 ntTSL 510.06□□□□□ -0.88e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-215ENST00000495776 2831 ntTSL 29.61□□□□□ -0.878e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.888e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.98e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-223ENST00000532975 581 ntTSL 49.4□□□□□ -0.98e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-226ENST00000534040 575 ntTSL 49.4□□□□□ -0.98e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.958e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-218ENST00000527631 563 ntTSL 44.69□□□□□ -1.668e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 OSBPL9-212ENST00000484890 640 ntTSL 31.71□□□□□ -2.148e-16■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.463e-11■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 NAT14-203ENST00000588985 730 ntTSL 532.5■■■□□ 2.793e-11■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.123e-11■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 NAT14-205ENST00000592719 545 ntTSL 525.18■■□□□ 1.623e-11■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.063e-11■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 GRAMD1A-212ENST00000600231 2534 ntTSL 231.83■■■□□ 2.692e-9■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.562e-9■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 GRAMD1A-213ENST00000603669 552 ntTSL 524.41■■□□□ 1.51e-6■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.482e-9■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.242e-9■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.951e-6■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 GRAMD1A-204ENST00000594597 567 ntTSL 415.77■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.992e-7■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.773e-6■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC8.47□□□□□ -1.053e-6■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.353e-9■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.793e-9■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.613e-9■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.523e-9■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 ATXN2-218ENST00000549455 568 ntTSL 423■■□□□ 1.276e-7■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.216e-7■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.926e-7■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.656e-7■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 ATXN2-210ENST00000483311 4159 ntTSL 1 (best)15.88■□□□□ 0.136e-7■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.036e-7■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.636e-7■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.036e-7■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC44.05■■■■■ 4.641e-6■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.963e-7■■■□□ 17.1
DROSHAQ9NRR4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.431e-12■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 ADD2-210ENST00000456320 997 ntTSL 523.62■■□□□ 1.371e-10■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 ADD2-214ENST00000522886 874 ntTSL 514.08□□□□□ -0.161e-10■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.965e-15■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 PHPT1-205ENST00000492540 1316 ntTSL 1 (best)30.42■■■□□ 2.465e-15■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 INTS11-245ENST00000533916 405 ntTSL 217.6■□□□□ 0.418e-7■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 INTS11-212ENST00000462432 2863 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.088e-7■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SLC39A10-204ENST00000418005 563 ntTSL 435.01■■■■□ 3.22e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SLC39A10-208ENST00000464301 571 ntTSL 423.9■■□□□ 1.422e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SLC39A10-207ENST00000458054 593 ntTSL 414.56□□□□□ -0.082e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SLC39A10-203ENST00000412905 337 ntTSL 313.01□□□□□ -0.332e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SLC39A10-205ENST00000430412 4478 ntTSL 27.75□□□□□ -1.172e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.582e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SLC39A10-206ENST00000444421 544 ntTSL 44.19□□□□□ -1.742e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.782e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.014e-7■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC44.15■■■■■ 4.663e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.933e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 RAB43-206ENST00000457077 574 ntTSL 428.28■■■□□ 2.123e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.313e-9■■■□□ 17
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