Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLMPQ9H6B4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLMPQ9H6B4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms