Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP62CLQ9H1M0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP62CLQ9H1M0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms