Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A8Q9C0K1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms