Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
YTHDF1Q9BYJ9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms