Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VN1R3Q9BXE9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms