Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms