Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF6Q99612 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms