Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms