Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OTUB2Q96DC9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB2Q96DC9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms