Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms