Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSH3Q8TE77 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSH3Q8TE77 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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