Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FSIP1Q8NA03 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms